Protein–RNA interactions for Protein: O15234

CASC3, Protein CASC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3O15234 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC3O15234 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC3O15234 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC3O15234 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC3O15234 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC3O15234 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC3O15234 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC3O15234 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC3O15234 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC3O15234 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC3O15234 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC3O15234 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC3O15234 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC3O15234 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC3O15234 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC3O15234 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC3O15234 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC3O15234 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC3O15234 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC3O15234 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC3O15234 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC3O15234 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC3O15234 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC3O15234 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC3O15234 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC3O15234 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC3O15234 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC3O15234 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC3O15234 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC3O15234 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC3O15234 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC3O15234 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC3O15234 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC3O15234 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC3O15234 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC3O15234 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC3O15234 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC3O15234 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC3O15234 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC3O15234 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC3O15234 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC3O15234 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC3O15234 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC3O15234 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC3O15234 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC3O15234 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC3O15234 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC3O15234 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC3O15234 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC3O15234 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC3O15234 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC3O15234 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC3O15234 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC3O15234 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC3O15234 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC3O15234 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC3O15234 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC3O15234 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC3O15234 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC3O15234 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC3O15234 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC3O15234 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASC3O15234 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASC3O15234 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASC3O15234 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASC3O15234 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASC3O15234 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC3O15234 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASC3O15234 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASC3O15234 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms