Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD3A6NKT7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD3A6NKT7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms