Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1LA6NFU8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PGPEP1LA6NFU8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms