Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 AL354707.1-201ENST00000615168 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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