Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF6P49848 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF6P49848 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF6P49848 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF6P49848 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms