Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UTRNP46939 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTRNP46939 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTRNP46939 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTRNP46939 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UTRNP46939 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTRNP46939 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTRNP46939 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTRNP46939 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms