Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPAG9O60271 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms