Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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