Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QRK9 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QRK9 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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