Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EYA3Q99504 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EYA3Q99504 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms