Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC10A2Q12908 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms