Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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CTLA4P16410 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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CTLA4P16410 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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CTLA4P16410 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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CTLA4P16410 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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