Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms