Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.3 ms