Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms