Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLCP48506 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLCP48506 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLCP48506 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLCP48506 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms