Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPD2P43304 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPD2P43304 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPD2P43304 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms