Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB2P26583 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB2P26583 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms