Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms