Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC009159.4-201ENST00000624606 2031 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms