Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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