Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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