Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA8P53708 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA8P53708 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms