Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL33A6NCF5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms