Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf19bA2A7Q9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms