Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms