Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FRMPD1Q5SYB0 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms