Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms