Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms