Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms