Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FOXF2Q12947 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FOXF2Q12947 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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FOXF2Q12947 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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FOXF2Q12947 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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FOXF2Q12947 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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FOXF2Q12947 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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FOXF2Q12947 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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FOXF2Q12947 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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