Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EP300Q09472 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms