Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms