Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms