Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC131934.1-201ENST00000527799 912 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC092810.1-201ENST00000429208 1224 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC098483.1-202ENST00000436515 967 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC104123.1-203ENST00000513158 575 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TDGF1-205ENST00000542931 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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