Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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