Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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