Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms