Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms