Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms