Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010200.1-201ENST00000547380 1454 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 NDRG2-212ENST00000403829 1500 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01719-204ENST00000611275 2054 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 TMSB15B-208ENST00000620307 2286 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 UBLCP1-201ENST00000296786 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 IFT43-201ENST00000238628 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 OR7C2-201ENST00000248072 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 GLOD5-201ENST00000303227 735 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10G6-201ENST00000307002 999 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 WFDC10A-201ENST00000372643 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC074254.1-201ENST00000399152 404 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 PRSS37-203ENST00000438520 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH1-IT1-201ENST00000438597 626 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC131097.4-201ENST00000442867 571 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM170A-204ENST00000567796 734 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 ANAPC11-205ENST00000571570 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007922.1-201ENST00000583122 459 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090409.1-202ENST00000586949 653 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.165-201ENST00000615681 260 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 BX005195.1-201ENST00000618097 1198 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 CU633904.1-204ENST00000624907 777 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02128-205ENST00000641755 1334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 TP53TG3D-202ENST00000398664 2029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-12Q9BQ66 DAP3-202ENST00000368336 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms