Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms