Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCNKBP51801 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms