Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSRP3P50461 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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