Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTAP49354 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTAP49354 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTAP49354 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms