Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms