Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms