Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms