Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRN3Q9NYV6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRN3Q9NYV6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms