Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMURF1Q9HCE7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMURF1Q9HCE7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms